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Les agents infectieux
Virus, bactries, protozoaires... microbes  dveloppement extracellulaire ou intracellulaire, bactries scrtant des exotoxines... face  chaque type de pathogne, ce sont des lments diffrents du systme immunitaire qui se rvlent efficaces.

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Le systme immunitaire
Les cellules du systme immunitaire sont produites dans la moelle osseuse ; les diffrentes lignes se diffrencient progressivement pour donner les cellules matures. Ces cellules peuvent avoir un rle effecteur direct (cellules phagocytaires, cellules cytotoxiques) ou agir par l'intermdiaire des protines qu'elles scrtent (immunoglobulines, cytokines).&#13; Des lments sont directement mobilisables et efficaces &#58; ce sont les dfenses innes. L'immunit adaptative se met en place plus lentement.

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Rponses innes et reconnaissance des pathognes
Lors des rponses innes, la reconnaissance de motifs molculaires caractristiques du monde microbien permet, avec un nombre limit de rcepteurs, la dtection de grands groupes de pathognes. Les enveloppes bactriennes notammment renferment de nombreux composs qu'on ne retrouve pas chez les vertbrs. Elles sont une des sources de MMAPs - motifs molculaires associs aux pathognes. Ces MMAPs sont reconnus par des rcepteurs cellulaires ou interagissent avec des molcules circulantes. Cette premire dtection des pathognes permet d'en limiter la multiplication (action antivirale des interferons), de mettre en alerte le systme immunitaire (raction inflammatoire) et de transmettre l'information aux cellules de l'immunit adaptative (maturation des cellules dendritiques).

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La slection clonale
La slection clonale explique la capacit du systme immunitaire  rpondre de faon spcifique  l'entre dans l'organisme de toute molcule trangre. Une telle spcificit est assure par l'existence d'un nombre norme de clones de lymphocytes exprimant chacun un rcepteur diffrent. Un antigne donn slectionne le clone qui porte le rcepteur qui lui est complmentaire et donc capable de le fixer avec la plus forte affinit. Le clone (ou les quelques clones) activ(s) et donc les anticorps ou les lymphocytes cytotoxiques forms ne seront pas identiques suivant la souche de bactries ou le mutant viral prsent.

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Le complexe majeur d'histocompatibilit 1
La reconnaissance d'un motif antignique par un clone de lymphocytes peut tre directe si l'antigne est prsent extracellulairement &#58; les lymphocytes B sont ainsi activs par contact avec un antigne prsent  la surface d'un microorganisme. Lorsque le pathogne se dveloppe  l'intrieur d'une cellule de l'organisme hte, une tape intermdiaire est ncessaire &#58; l'antigne doit tre apprt par protolyse et prsent sous forme d'un peptide associ  une molcule code par le complexe majeur d'histocompatibilit (CMH). C'est l'ensemble, molcule du CMH - peptide antignique, qui constitue l'lment responsable de la slection clonale des lymphocytes T. Les molcules codes par le CMH sont des rcepteurs  peptides antigniques et des prsentoirs de l'antigne aux lymphocytes T.

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Le complexe majeur d'histocompatibilit 2
Le complexe majeur d'histocompatibilit (CMH) est polygnique et le polymorphisme pour certains gnes est trs lv. La nomenclature, diffrente chez l'homme et chez la souris, mrite quelques exercices.

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La diversit des rcepteurs antigniques &#58; exemple des immunoglobulines
La dtection des antignes repose sur l'existence d'un nombre immense de clones de lymphocytes. C'est l'tude des immunoglobulines qui a permis de dcrire en termes molculaires la diversit des rcepteurs (les rcepteurs ports par deux clones diffrents ne diffrent que par quelques pourcents de leur structure = le site de fixation de l'antigne form par la runion des rgions hypervariables) et de comprendre comment elle est gnre (par un phnomne original de recombinaison somatique de segments d'ADN, rarrangement diffrent pour chaque clone de lymphocytes).&#13; Les tudes menes sur les immunoglobulines solubles s'appliquent directement aux immunoglobulines membranaires qui constituent les rcepteurs des lymphocytes B pour les antignes (ou BCR) et pour l'essentiel au rcepteur pour l'antigne des lymphocytes T (ou TCR).

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Organes lymphodes et trafic des lymphocytes
La rencontre d'un antigne (peu abondant) et des clones de lymphocytes spcifiques de cet antigne (un faible nombre de cellules dans un organisme non immunis) est optimis dans les organes lymphodes secondaires o dfilent en continu les lymphocytes et o sont apports, par le sang ou la lymphe, les antignes.

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Slection des lymphocytes
La recombinaison des segments d'ADN qui donnent naissance dans chaque clone de lymphocytes aux squences codant pour le rcepteur antignique se fait au hasard, sans rfrence  un quelconque antigne. Certains clones peuvent exprimer des rcepteurs susceptibles de reconnatre des motifs molculaires prsents dans l'organisme hte. Ces clones potentiellement autoractifs sont limins (ou seront paralyss) . Les clones de lymphocytes T dont le TCR ne prsente pas d'affinit pour les molcules du CMH exprims sur les cellules de l'hte sont galement limins.

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Cellules dendritiques et prsentation des antignes
Les cellules dendritiques font le lien entre immunit inne et immunit adaptative. Prsentes au site de l'infection, elles capturent les microorganismes. L'interaction avec des MMAPs (motifs molculaires associs aux pathognes) modifie les potentialits des cellules dendritiques (maturation) qui quittent les tissus priphriques pour migrer vers les organes lymphodes secondaires ; elles prsentent alors des peptides issus de la digestion des microbes, fixs sur des molcules du CMH, aux lymphocytes TCD4<sup>+</sup>.

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Activation des lymphocytes T CD4<sup>+</sup>
L'activation des lymphocytes TCD4<sup>+</sup> nafs requiert deux signaux &#58;&#13; <ul><li> la reconnaissance par le TCR d'un peptide antignique port par une molcule de classe II du CMH,</li>&#13; <li>une costimulation par une cellule dendritique mature (qui a t en contact avec un pathogne).</li></ul>&#13; L'activation entraine la prolifration du clone de lymphocytes, la diffrenciation et la production de cytokines.&#13; Les voies de signalisation intracellulaires mises en jeu lors de l'activation sont particulirement bien tudies et des cibles pour des traitements immunosuppresseurs ont pu tre identifies.&#13;

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Les cytokines
Les cytokines sont des protines qui assurent la communication entre les cellules du systme immunitaire et entre les cellules du systme immunitaire et d'autres cellules de l'organisme.&#13; Les sources principales de cytokines sont les lymphocytes TCD4<sup>+</sup> activs (cytokines de la rponse adaptative) et les macrophages stimuls par contact avec un microbe (cytokines pro-inflammatoires). Les cytokines exercent des fonctions multiples &#58; facteurs de croissance, de diffrenciation, agents chimiotactiques, inducteurs de mort cellulaire...

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Les sous-populations de lymphocytes T
Les rponses  diffrents types de pathognes (bactries  croissance extracellulaire ou intracellulaire, parasites de grande taille...) mettent en jeu des acteurs diffrents. L'adaptation de la rponse immune  l'infection qui se dveloppe est orchestre par diffrentes sous-populations de lymphocytes T CD4<sup>+</sup> "effecteurs". Chaque sous-population (Th1, Th2, Th17...) se diffrencie dans un contexte particulier de rponse inne, produit un ventail de cytokines diffrentes et stimule des mcanismes effecteurs diffrents.

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Activation des lymphocytes B
L'activation des lymphocytes B et celle des T prsentent des similitudes (structure des rcepteurs, voies de signalisation mises en jeu). Certains processus sont propres aux lymhpocytes B &#58; &#13;<ol><li> leur capacit  endocyter l'antigne leur permet d'tre des cellules prsentatrices de l'antigne pour les cellules T, </li>&#13;<li> aprs activation, ils se diffrencient en plasmocytes qui produisent abondamment une forme soluble du rcepteur pour l'antigne - les immunoglobulines scrtes ou anticorps,</li> <li> en rponse secondaire, des phnomnes d'hypermutation somatique et de commutation de classe, permettent la production d'anticorps de forte affinit et aux potentialits effectrices diverses.&#13;</li></ol>

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Les anticorps
Les anticorps exercent des fonctions propres (neutralisation) ou cooprent avec des lments de l'immunit inne en accroissant leur efficacit (aide  la phagocytose, par exemple). Des anticorps de diffrents isotypes ont des potentialits diffrentes (stabilit, structure oligomrique, localisation, rcepteurs reconnus...).

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La phagocytose
La phagocytose est un mcanisme simple et relativement efficace pour liminer les agents infectieux. Deux types de cellules spcialises, les phagocytes professionnels, sont capables d'ingrer et de digrer de nombreux microorganismes. En quoi la phagocytose diffre-t-elle des autres mcanismes d'endocytose ? Pourquoi deux types de cellules phagocytaires ? Les neutrophiles et les macrophages ont  la fois des proprits communes et prsentent des diffrences dans leur mode de recrutement, leur dure de vie... Les diffrentes tapes de la phagocytose sont l'attachement de la particule  phagocyter  la surface de la cellule phagocytaire, son ingestion puis sa digestion. Des mcanismes toxiques comme la production de drivs activs de l'oxygne participent  la destruction des microorganismes. L'efficacit de la phacocytose est limite par des mcanismes d'chappement mis en jeu par certains microorganismes &#58; non reconnaissance, attachement sans ingestion, rsistance  la digestion, utilisation des macrophages comme site de rsidence et multiplication. La phagocytose est donc un bon exemple de l'importance de l'immunit inne et de ses limites. Lors du dveloppement de la rponse adaptative, la production d'anticorps permet, via les rcepteurs pour le fragment Fc des immunoglobulines (RFc) exprims sur les cellules phagocytaires, une phagocytose trs efficace.
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Le systme du Complment
L'activation du systme du complment, c'est la gnration en cascade de protases qui librent des peptides inflammatoires, des opsonines facilitant la phagocytose et permettent finalement la formation d'un complexe d'attaque membranaire capable de lyser certaines bactries. Puisque les lments du complment sont prsents en permanence dans la circulation sanguine, le contrle de l'activation et les systmes de protection des cellules de l'organisme hte sont essentiels.

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La cytotoxicit
L'apoptose des cellules infectes par un virus ou par un microorganisme  dveloppement intracellulaire est induite par un contact entre un lymphocyte T CD8<sup>+</sup> et la cellule-cible. La cytotoxicit des cellules NK s'exerce par le mme mcanisme que celle des T CD8<sup>+</sup>, mais le mode de reconnaissance des cibles est diffrent, les cellules NK relevant de l'immunit inne. La mort cellulaire peut galement tre induite par l'interaction des rcepteurs TNF-R et Fas avec leurs ligands.
